Les microorganismes, dans toute leur variabilité, forment de très loin le plus grand réservoir de diversité de la biosphère. Ils impactent et modifient le système planétaire tout entier, vivant libres ou associés à un hôte comme une algue, une plante ou un métazoaire (homme, insecte…). Ils interagissent pour former des réseaux complexes au sein du microbiome : évoluant de manière dynamique, en réponse à leur environnement et en influençant leur écosystème.

Les concepts et approches omiques permettent de déterminer avec un niveau de résolution fin les composants (gènes, taxons et fonctions) de tous systèmes biologiques et écologiques, permettant d’envisager l’étude de ces microbiomes. Mais la richesse et la complexité des données issues de ces approches omiques nécessitent le développement de méthodes mathématiques et informatiques nouvelles pour analyser les données, en déduire la nature et l'intensité des interactions et des transferts entre composants afin de modéliser le système via différents modèles dont on pourra décrire les propriétés.

Cette première journée d’animation est à destination des acteurs de la communauté Bretagne – Pays de la Loire, ayant comme objet d'étude des communautés de microorganismes dont les interactions pourraient s’avérer fondamentales pour comprendre et influer sur les spécificités d’espèces d’intérêt en agriculture (insectes, poulets), mer (algues) mais aussi en santé.

Faire un tour d’horizon des méthodologies, questions biologiques et points de blocages des projets du Grand Ouest, et identifier les points communs et spécificités de chacun de ces sujets d’études, afin d’aller vers des projets utiles à la communauté pour l’innovation conceptuelle et méthodologique pour la modélisation de microbiomes variés.

Cette journée se déroulera de 9h30 à 17h30 le lundi 26 Juin 2017, sur le campus de Beaulieu à Rennes dans les locaux d'INRIA Rennes Bretagne Atlantique.

L'inscription est gratuite mais obligatoire avant le 23 Juin. Un cocktail déjeunatoire vous sera offert en milieu de journée.

Nous invitons les participants à venir présenter leurs travaux lors de la session de l'après-midi, sous forme de micro-présentations d'une dizaine de minutes.

Format des micro-présentations :

1. Sujet d'étude et questions biologiques
2. Méthologies et outils utilisés
3. Limites et points de blocage rencontrés

Un très court résumé vous est demandé pour ceci dans la section "Dépôts".